Словарь русских фамилий:
В имеющихся у меня источниках такая фамилия не объясняется. Можно предложить следующие. Прозвище каныга, ставшее основой фамилии может быть вариантом ханыга в значении попрошайка, канюка (Даль) от глагола канючить.
© «СловоТолк.Ру» — толковые и энциклопедические словари, 2007-2020