Словарь русских фамилий:
В имеющихся у меня источниках такая фамилия не объясняется. Можно предположить следующее. Скорее всего фамилия белорусская. Вероятно от прозвища Халупа, Халупник — бобыль, безземельный крестьянин.
© «СловоТолк.Ру» — толковые и энциклопедические словари, 2007-2020